在调查中发现, 很多生物实验室的安全柜安装放置位置不符合生物安全要求。主要存在问题是生物安全柜未放置在回风口一侧, 违背了生物安全实验室气流流向从清洁（空间向∋污染（空间流动的原则,不易把实验室内形成的污染空气从排风口及生物安全柜内带走, 极易造成室内回流与涡流。
  调查中还发现, 很多使用单位选择安全柜过分超前,常常在 A 2型能满足应用的情况下选用 B2型, 造成问题很多。一是 B2型安全柜排气量达到约 1 600 m3/h （型号不同有差异） ,如果房间没有足够的补充风量, 安全柜不能开启, 根本无法正常工作,有很多实验室无奈只好打开门开机,这显然不符合生物安全实验室规范要求。二是室内空气大量外
排,要保证实验室内温度满足实验要求,需要空调和加热器的负荷非常大, 现已建好的实验室根本无法满足,也造成能源浪费。三是还有一些单位选择带有电动前窗的安全柜, 误以为电动就是功能超前。其实不然,因为安全柜在路供电系统情况下,如果突然停电,电动窗无法关闭, 有害物外泄会造成实验室污染和感染事件, 而且, 不论电动还是手动,操作高度都是固定的, 因而这种电动功能意义不大并有很大潜在危害。因此, 安全柜的选择应根据自身实验对象需要,主要从安全柜的性能考虑,如过滤器、 风路设计、 报警装置、 负压保护、 气流组织、 噪音强度等指标比较安全柜的优劣。
      另外,有的生物安全柜放置于通道处或者是主实验室间的入口处,工作人员的频繁走动以及开关门,极易破坏安全柜的气流,应尽量把安全柜安放在有利于形成气流由清洁区域流向污染区域的单向气流流型的地方, 同时生物安全柜后方与两个侧面应各留出 30 cm的空间, 以便于日后维护,顶部应留出 30~ 35 cm的空间,以便准确测量空气通过排风
过滤器的速度,并便于排风过滤器的更换。
      随机调查观察中发现, 实验人员存在使用生物安全柜操作不当现象,主要表现在相关检测人员在生物安全柜内菌种传代、 划平板时使用酒精灯灼烧接种环,这是一种非常不安全的操作,首先是明火会破坏定向气流的方向,并且在处理挥发性物品和易燃物品时,也易造成危险;其次是酒精灯燃烧温度升高对安全柜顶层的过滤膜有损害, 加速其老化。如
果顶层的过滤膜失去作用, 所谓生物安全柜也就失去其应有的作用。建议接种环、 接种针灭菌时使用微型燃烧器。